雍正時期，編青海蒙古為2十7旗，后增至2十9旗，由西寧辦事大臣主持會盟。黃河以南主要為藏人，設(shè)有4十個土司，其中以玉樹土司最大，故稱玉樹等4十族土司。
青海地處回、藏之間，地理位置絕佳，足以鉗制回、藏。正因為如此，青海設(shè)省理所應(yīng)當(dāng)。特設(shè)巡撫1名，由西寧辦事大臣改任，同樣推行郡縣制。
西藏在清代分為衛(wèi)、喀木康、藏、阿里4部，以及霍爾3十9族地區(qū)。地方最高行政長官為駐藏大臣，駐拉薩，會同**喇嘛、班禪額爾德尼辦理藏內(nèi)政務(wù)，其政令由噶廈西藏官府執(zhí)行。
那曲、昌都地區(qū)北部的各部落統(tǒng)稱霍爾3十9族，簡稱3十9族，為蒙古人后裔，由駐藏大臣的屬員夷情章京管轄。
西藏地位特殊，暫不設(shè)置行省，仍由駐藏大臣辦理政務(wù)。其中，涉外、邊防事務(wù)，權(quán)力仍歸清廷。
有清1代，蒙古是滿人的重要盟友，在明清戰(zhàn)爭中發(fā)揮了重要作用。蒙古各部參照滿洲8旗，劃分為蒙古8旗，受到清廷的優(yōu)待，對清朝頗為忠心。
蒙古分為內(nèi)屬蒙古與外藩蒙古。
內(nèi)屬蒙古包括察哈爾、歸化城土默特、唐努烏梁海、阿爾泰烏梁海等部，各旗由朝廷派遣官員1般為總管治理，與內(nèi)地的州、縣無異。
外藩蒙古各旗則由當(dāng)?shù)氐氖酪u扎薩克管理，處於半自治狀態(tài)。在外藩蒙古，以若干旗合為1盟，設(shè)正、副盟長，掌管會盟事宜，對各旗札薩克進行監(jiān)管。
清朝歷來都很重視蒙古，長期與蒙古聯(lián)姻，得到蒙古的效忠。在平定準(zhǔn)噶爾部落的反叛后，蒙古各部已經(jīng)絕意反叛。乾隆時期，土爾扈特部落跋涉萬里，從沙俄東歸中國，受到清朝的禮遇。
鑒于這種緊密的聯(lián)盟關(guān)系，咸豐決定繼續(xù)保持蒙古的特殊地位，不在蒙古設(shè)置行省。
東北是清朝龍興之地，清廷實行封禁政策，禁止?jié)h人出關(guān)移民墾殖。關(guān)外為皇家禁地，自成體系。
1方面是8旗駐防系統(tǒng)，以盛京為陪都，設(shè)盛京將軍為最高軍政長官，置戶、禮、兵、刑、工5部，各設(shè)侍郎主持，并在吉林、黑龍江設(shè)駐防將軍。將軍之下，設(shè)專城副都統(tǒng)分駐各城，并管理各城的臨近地區(qū)。
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